霰弹枪蛋白质鉴定

复杂性问题
在典型的霰弹枪蛋白质组学实验中，来自超过一百万个蛋白质形式的肽，覆盖高达10个浓度级别的级别通过纳米LC分离，通常使用2小时梯度。这代表了质谱仪的重大挑战，该质谱仪必须尽可能多地检测，分离和碎片作为数百万份的数百万份。为了产生广泛的蛋白质识别信息，将离子迁移性添加为分离的额外尺寸，具有显着增加峰值容量的潜力。但是，这不得损害速度或敏感性。

Tims-Pasef®.
TIM的独特设计使得PaseF®方法能够从离子迁移率的集中分组从离子迁移率的宽度，宽度为2-5毫秒，从而实现MS / MS采集速度> 100Hz和接近100％的占空比。因此，在速度和灵敏度的增加之上获得额外的分离，而TOF分析仪允许在所有MS和MS / MS速度下维持超高MS / MS分辨率。

具有PaseF®的TimStof Pro导致特殊的蛋白质识别性能和分析深度。当与纳米型纳米流量UHPLC和Captivespray离子源耦合时，TIMSTOF Pro可以常规地鉴定超过200ng的5000个蛋白质基团，其与90分钟梯度分离的Hela细胞消化。

PaseF®为了提高霰弹枪蛋白质组学的吞吐量
现象速度可用于降低梯度时间并增加吞吐量，同时保持前所未有的分析深度。接近4000个蛋白质基团可以从100ng的Hela细胞摘要中鉴定为30分钟的梯度。

源于TIMS分离的显着敏感性增加使得能够进行新的低浓度样本的可能性。使用标准PaseF®方法，具有额外调谐，12NG用60分钟梯度分离的Hela细胞摘要，鉴定超过2900个蛋白质组。

理想的临床蛋白质组学伴侣
Pasef®最终允许临床蛋白质组学成为现实。系统的速度和敏感性的组合可重复鉴定1400多个HeLa细胞蛋白基团，从5分钟注射用5分梯度分离。